Gaussian结构优化相关问题

# 结构优化
将初始结构优化到一个**极小值**
eg:
`opt`
`opt(recalc=5,gdiis)`
`opt=(ts,noeigen)`
`opt=gdiis`
`opt(recalc=5)`
`opt=recalc=5`
==注：recalc关键词只能在gaussian16 b.01及之后的版本中使用。==

# 结构优化收敛的条件
win：右键-result-optimizations查看
linux：grep
```
Maximum  Force            0.000450
RMS      Force            0.000300
Maximum  Displacement     0.001800
RMS      Displacement     0.001200
```

# 限制性优化(固定优化)
- 以下这些情况可以通过固定距离来解决：
	- 配位水老是跑
	- 氢键老是跑
	- 环氧老是跑
	- 找过渡态
- 用法
具体格式详见[gaussian输入文件模板](http://doc.liuyaoze.com/project-6/doc-96/ "gaussian输入文件模板")中的模板1、2。

```bash
	opt=modredundant
	#坐标结束后空一行开始填写需要固定的距离，一个或者多个都行
	B 1 2 F

#松开距离有两种方法
	#第一种
	#读取chk文件中的结构，将F改为A；
	B 1 2 A
	#第二种
	或直接导出log文件中的结构并去掉modredundant后直接算
```

# 优化中可能会出现的问题
- Error termination request processed by link 9999.
	![](/media/202211/2022-11-29_192028_384049.png)
	1. 微整结构(从log文件里找个相对合理的构象微调导出)。
	2. `opt=gdiis`

- 震荡
	![](/media/202211/2022-11-29_191210_880333.png)
	- 受力震荡
		降低recalc取值；
	- 位移震荡
		1. `opt=gdiis`
		2. `opt=(gdiis,maxstep=3,notrust)`

![](/media/202211/2022-11-29_191256_381756.png)

- 某个条件几乎已经快收敛了忽然又升高
	![](/media/202211/2022-11-29_192457_494971.png)
将快收敛附近的结构导出（或直接从chk文件中读取）
`opt=(gdiis,maxstep=3,notrust)`

- FormBX had a problem.
	使用Cartesian坐标（不能和modredundant/gdiis联用。）
	`opt=Cartesian`

- SCF error
	![](/media/202211/2022-11-29_192059_565711.png)
	1. 省事儿的做法
	`opt scf=xqc`
		**优化完成后去掉这个关键词重算再一遍，以第二遍的结果为准。**
	
	2. 更加优雅的做法应该参考卢天老师写的博文[《解决SCF不收敛问题的方法》](http://sobereva.com/61 "《解决SCF不收敛问题的方法》")。

- 虚频
右键-result-vibrations
	1. 降低recalc取值
	2. 选中虚频，使用manual displacement功能手动offset一半的虚频后保存重算。
	![](/media/202211/2022-11-29_191503_826132.png)

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